6/1
公告修訂「全民健康保險西醫基層提升心肺疾病復健照護品質計畫」，並自115年6月1日生效。
6/2
捷克眾議院議長韋德齊率團訪問本部，由石部長崇良親自接待，感謝捷克長期支持我國參與世界衛生大會（WHA），期盼持續深化雙邊合作；資訊處並報告臺捷合作藍圖及自主研發「FHIR Box」系統。
6/2
公告修正「指示藥品審查基準」。
6/3
本部石部長崇良及疾病管制署羅署長一鈞，赴桃園國際機場視察防堵伊波拉病毒之跨機關聯防措施，並宣布自115年6月3日起至6月30日止，具剛果民主共和國及烏干達旅遊史之無症狀國人及入境旅客，提供自願性免費採檢。
6/5
修正發布「全民健康保險醫療服務給付項目及支付標準」：特定診療新增「脈衝振盪肺功能」檢查項目，自115年7月1日生效。
6/5
公告「衛生福利部中央健康保險署透析液容器成本補貼作業要點」，並自115年6月5日起生效。
6/5
本部石部長崇良、中央健康保險署陳署長亮妤參加「扶輪募集全球愛心 健保偏鄉遠距送暖」遠距醫療設備捐贈儀式，見證國際扶輪3481地區捐贈遠距設備予偏鄉醫療院所。
6/15
本部莊常務次長人祥出席「臺北市中正區社區心理衛生中心」揭牌啟用儀式，全國布建累計達73處。見證中正區心衛中心「服務升級」，構築「預防、介入、復元」全方位心理健康支持體系，讓民眾「找得到資源、看得到專業、獲得到即時支持」。
6/15
發布訂定「外國專業人才及其眷屬長期照顧服務申請及給付辦法」，並自115年6月30日起施行。
6/16
本部醫事司舉辦「困難兒藥『暢』同『調』，寶貝甲你攬牢牢記者會」，由石部長崇良蒞會致詞，說明本部為改善兒童臨床必要藥品及醫材取得困難問題，於108年成立「兒童困難取得之臨床必要藥品及醫材調度中心」，透過聯合採購、簡化流程及跨院調度等策略，已有效提升醫療院所取得效率並減輕行政負擔。
6/16
本部林政務次長靜儀接見澳洲辦事處偕同CSL Behring亞太區副總裁Jean-Marc Morange及臺灣公司劉總經理英毅等一行，就臺灣「國血國用」政策、該公司血液製劑發展規劃及血友病基因治療新產品的引進等事，進行意見交流。
6/17
公告修訂「全民健康保險中醫門診總額支付制度品質確保方案」附表。
6/22
本部莊常務次長人祥出席「臺南市麻豆區社區心理衛生中心暨心理健康教育館」揭牌啟用儀式，全國布建累計達74處。透過中央與地方攜手打造「全臺首座心理健康教育館」，落實WHO心理健康策略「有心理健康才有真正的健康」，提供民眾「足、安、心」心理健康服務。
6/22
本部資訊處接待財團法人國際合作發展基金會「AI醫學影像分析應用技職班」18名友邦及友我國家醫師、放射師參訪，展示我國AI醫療影像技術發展成果。當日由石部長崇良親臨致詞，李處長建璋分享AI醫療影像落地應用，智捷醫學科技展示數位醫療影像與MR技術。
6/22
公告「衛生主管機關認可衛生講習機關（構）暨辦理衛生講習注意要點」，並自115年8月1日起實施。
6/22
發布訂定「外國專業人才及其眷屬身心障礙者福利與服務需求評估辦法」，並自115年6月30日施行。
6/23-24
「2026臺美衛生福利政策研討會」邀請美國猶他州衛生福利部部長Tracy Gruber、緬因州疾病管制及健康署署長 Puthiery Va、公共衛生研究院總裁兼執行長Melissa Stafford Jones、路易斯安納州衛生部部長Bruce Greenstein及華盛頓州衛生部部長Dennis Worsham、杜克大學政策與組織管理研究中心Prof. Pikuei Tu、Prof. Cheryl Lin 等7位外賓來臺，擔任研討會講座，並參訪本部及所屬機關進行經驗交流及參訪。會中石部長崇良以「全方位衛福韌性：打造守護全民的永續體系」為主題進行演講，分享全球健康照護挑戰及因應策略等內容。
6/23
本部呂政務次長建德接見以色列社福部副總司長Rakefet Ben-Gui Rosenstein訪問團，就ICF認定流程及模式轉換等議題進行交流。此次係繼去年社福部總司長率團訪臺後，以方主動提出來臺需求，盼透過與各司署實務研討會議、機構參訪及參加ICF國際研討會共6日的深度交流，學習臺灣推動ICF多年經驗，作為其制度建置之重要參考。
6/24
修正發布「全民健康保險藥物給付項目及支付標準」第13條：因應「治療用」放射性藥品之發展，刪除第1款「放射線製劑」文字；另「診斷及監測」等放射性藥物，維持以醫療服務診療項目支付，自發布日生效。
6/24
本部林政務次長靜儀接見斯洛伐克國會議員訪問團，雙方就全民健康保險制度、社會福利制度及醫事人力、長照及少子女化對策等議題交換意見。
6/24
公告訂定「以基因改造大腸桿菌K-12 DH1 MDO MAP1001d菌株發酵生產之食品原料2ʹ-岩藻糖基乳糖與雙岩藻糖基乳糖混合物之使用限制及標示規定」。
6/29
本部林政務次長靜儀、呂政務次長建德及以色列衛生部次長Asher Salmon召開雙邊次長級線上會議，就臺以合作行動計畫進行討論，合作項目聚焦於災害準備應變與強化韌性醫療體系。
6/29
本部林政務次長靜儀及呂政務次長建德接見新任以色列駐代表 Israel Strulov，雙方就緊急醫療應變、衛生與社福部門整合、志工管理、政府與NGO協作及115年8月以方衛生部官員來臺交流等議題交流討論。
6/30
修正發布「全民健康保險醫療服務給付項目及支付標準」：修正西醫基層院所一般門診診察費合理量計算方式，自115年8月1日生效。
6/30
本部石部長崇良接見瓜地馬拉衛生部長Joaqu璯 Barnoya及次長Edgar Rolando Gonz嫮ez。雙方就食品藥物管理署職掌、我國藥品管理機制、癌症預防篩檢及治療等議題交換意見。
6/30
本部疾病管制署表示，輪狀病毒疫苗將於116年1月1日納入幼兒公費疫苗接種，並同時提供2劑型與3劑型供民眾選擇，首年預估12萬名幼兒受惠。屆時公費幼兒常規疫苗將增至10種，可預防15種傳染病。
